Crocodile est un Shichibukai très puissant, cependant, même en travaillant pour le gouvernement, il complote toujours dans leur dos. Il est le chef de Baroque Works, sont but est de trouver Pluton, une arme destructrice. Il combattra Luffy un première fois dans le désert, puis une seconde fois à Alabasta.
Il rejoindra Robin dans le temple secret d'Alabasta, où l'emplacement de Pluton doit y être inscrit. Mais Robin ne voulant pas lui réveler où se trouve l'arme, Crocodile la blesse gravement.